Face ao abandono de grande parte do seu plantel, o União de Leiria apresentou-se apenas com oito jogadores (Marinha Grande, 29 de abril de 2012).
Mas todo o esforço desenvolvido com a participação nas competições europeias, obrigando a atribulados começos de época, acabou por se refletir no desempenho da equipa. A descida à então já chamada segunda liga aconteceu no final dessa época de 2007/08.
Na época que se seguiu, após um desanimador começo, a equipa reergueu-se com o carismático treinador Manuel Fernandes e, acompanhada pelo entusiasmo crescente dos adeptos, acabou por assegurar o regresso ao escalão maior.
Mas, se nas duas temporadas seguintes, o clube ainda conseguiu manter o nível a que habituara os leirienses, com o início da época de 2011/12, ao acentuarem-se as divergências entre a S.A.D., sempre polemicamente gerida por João Bartolomeu, e a empresa gestora do estádio municipal, o consequente afastamento dos órgãos autárquicos e dos leirienses veio criar condições para aquilo que viria a acontecer na primavera de 2012: o campeonato da primeira liga foi concluído penosamente pela equipa, no último lugar, com acontecimentos rocambolescos a deixarem muito afetada a imagem do clube. Por decisão da Liga, o afastamento compulsivo das competições profissionais veio logo de seguida.